4月29日，全國內地9個省份報告有新增非典型肺炎臨床診斷病例和疑似病例，1個省份報告有新增臨床診斷病例，8個省份報告有新增疑似病例，其餘13個省份為零報告。截至4月29日10時，報告有疫情的省份仍為26個。
4月28日10時至29日10時，全國內地共報告新增非典型肺炎臨床診斷病例202例（其中醫務人員57例），治癒出院16例，死亡9例。其中北京152例（其中103例為新發病例，49例為疑似病例轉為臨床診斷病例），治癒出院5例,死亡7例；天津1例；河北9例，死亡1例；山西23例，出院1例；內蒙古7例，死亡1例；安徽1例；河南1例；廣東4例，治癒出院10例；廣西1例；陝西3例。截至4月29日10時，全國內地共累計報告非典型肺炎病例3303例（其中醫務人員709例。北京排除既往臨床診斷病例4例，含醫務人員1例；內蒙古昨日重複報告1例，今日剔除），治癒出院1322例，死亡148例。
4月28日10時至29日10時，各地還報告新增非典型肺炎疑似病例321例。其中北京149例；天津8例；河北12例；山西49例；內蒙古30例；遼寧2例；上海1例；江蘇1例；安徽1例；河南3例；湖北2例；湖南1例；廣東54例；重慶2例；四川4例；陝西1例；甘肅1例。截至4月29日10時，全國內地非典型肺炎疑似病例累計為2259例。
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