BBC消息，臺灣行政院例行在星期三召開的院會，這次由政務委員蔡清彥提出專案報告。蔡清彥在報告中指出，包括臺灣最高治安單位警政署等數十個政府機關，最近遭到中國大陸黑客不斷入侵，這些入侵者企圖在臺灣政府網站植入"木馬程式"，適時再破壞網站、竊取資料。
蔡清彥表示，根據臺灣相關單位掌握的資料顯示，這些黑客集中在大陸兩個特定省分。
有系統攻擊？
臺灣方面懷疑，這些黑客很可能是大陸當局有計畫、有系統的，在網路上布建"網軍"，進行資訊戰的操演。
臺灣行政院發言人林佳龍隨後對外說明表示，這次的黑客入侵作法與以往黑客入侵破壞電腦系統方式不同，是植入"木馬程式"，保留在政府機關網站內，並未立即啟動竊取資訊或破壞電腦，而是選擇適當時機再啟動。
也因此，停留在政府機關網站內的"木馬程式"暫時不會造成重大傷害，但若是有計畫的資訊戰，一旦時機一到全面發動攻擊，則影響驚人。
下令徹查
林佳龍表示，這些黑客入侵臺灣的方式，包括利用臺灣民間公司為跳板，再運用此管道聯結，入侵政府部門網站。林佳龍並表示，中共黑客入侵臺灣民間機構，也是企圖以這項操作策略來掩護身份。
臺灣行政院長游錫堃星期三聽取報告後，相當重視這項訊息，已立即指示各部會徹底清查網站，在星期五（5日）之前各部會匯報遭入侵情形給"國家資訊通報單位"進行修復；而到時若未能據實通報，被查獲者，單位首長將予以嚴懲。
臺灣行政院星期三並沒有具體說明有那些政府部門網站遭到大陸黑客入侵。而在臺灣媒體關切下，國防部與法務部都對外表示，並未發現大陸駭客入侵網站。
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