這九大突出矛盾和問題分別是：
1.低生育水平不穩定。現行生育政策和群眾生育意願的矛盾依然突出，在人口憂患意識淡化、行政手段弱化和利益導向政策滯後的條件下，任何盲目樂觀和麻痺鬆懈的思想情緒，任何政策的偏差和工作的失誤及外部環境的不利影響，都可能導致生育水平的回升。
2.人口總量持續增長。今後20年左右，中國總人口仍以每年淨增1000萬左右的速度持續增長。據預測，按總和生育率1.8計算，2034年人口達到14.86億後可能實現零增長；如果將一些複雜多變因素考慮進來，按總和生育率2.0計算，21世紀中葉的2043年，人口將達到15.57億。這就是說，中國總人口還要增加近3億，在接近16億之後方能實現零增長。
3.人口總體素質不高。中國新生兒出生缺陷發生率年均4%－6%，約80萬到120萬。6000萬殘疾人中，1200萬屬於呆傻和弱智。6000萬左右地方病患者，波及全國1800多個縣(市、區)。同時，中國在人口健康水平、人均受教育程度、人們的道德心理等方面均存在一些突出問題。人類發展指數居世界104位，屬人力資源低下的國家之一。
4.人口結構性矛盾日益凸現。一是出生人口性別比持續升高，第五次全國人口普查已達117。0至9歲人群中男性比女性多1277萬。長期下去，將引發一系列社會問題。二是人口老齡化進程加快，65歲以上老年人口，2020年將佔全國總人口的11.8%，21世紀中葉將佔全國總人口的1／4。更為嚴重的是，中國農村人口老齡化水平高於城鎮。發達國家一般在人均GDP10000美元時進入老齡社會，中國是在不足1000美元的情況下進入老齡社會，因此，老年健康和保障問題面臨嚴峻挑戰。
5.就業壓力十分巨大。2020年，中國適齡勞動人口將達9億多，比發達國家勞動力的總和多3億。每年城鎮新增勞動力近千萬，農村剩餘勞動力兩億多，龐大的人口和無序的流動構成中國就業市場的巨大壓力和社會管理的困難。
6.公共衛生預防保健體系十分薄弱。80%的衛生資源集中在城市；2000年農村人均預防保健經費僅有12元；3億左右的人喝不上潔淨水；1億多人得不到及時的醫療服務；乙肝病毒攜帶者1.2億人；愛滋病傳播進入快速增長期，80%的感染者在農村，暴發傳染的可能性極大。
7.新的困難群體開始顯現。率先實行計畫生育的家庭，父母相繼進入老年，特別是獨生子女和雙女戶家庭父母年邁而缺乏保障，生活陷入困難。
8.人口與資源、環境的矛盾依然尖銳。中國人口正在逼近目前科學發展狀況下自然環境容量的極限。龐大的人口在未來幾十年給資源和環境帶來的壓力和影響極為深遠。
9.人口和計畫生育經費投入嚴重不足。農村稅費改革全面實施後，基層人口和計畫生育工作的正常經費缺口很大。20多年來建立起來的基層工作和服務網路在不少地方特別是貧困地區陷入困境。
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