北京中華工商時報報導，東方航空集團總裁葉毅干預測，如果SARS影響持續的話，集團到六月份的累計虧損將達二十三億元人民幣。SARS對中國大陸民航業的影響不僅甚於美國「九一一事件」和美伊戰爭，而且遠遠超過曾重創亞洲經濟的亞洲金融危機。
報導指出，目前中國大陸三大航空公司都在縮減航班，旅遊地航班陸續取消。據瞭解，在廣州白雲機場起飛的航班，原來飛往北京每天有近二十架次，減少到現在只有三個航班。同樣，從廣州飛往上海的航班，東航、國航、南航三大航空公司每天原來都各有六個航班，但現在都縮減到一至二班。部分飛往旅遊城市，如麗江、黃山、武夷山等地的航班全被取消。
疫情對航空業的打擊不僅體現在客運量下降和航班縮減上，由於在疫情期間必須做好大量的消毒和防治工作，使得營運成本不斷上升。目前，幾乎國內所有的航空公司都已承認，疫情對自身業務的影響是空前的。
雖然中共財政部和國家稅務總局已經決定今年五月至九月對民航企業實行免征營業稅、免征基礎設施建設基金，減免總額達到百分之八，但多數航空公司認為政府補助仍然不夠。
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