北京青年报报导，三峡库区船舶平均流量一年达十万余艘，仅在重庆登记注册的船舶就有一万多艘。据中国环保部门测算，光是“重庆市籍”的各类运输船舶，每年产生垃圾就达四万两千吨、粪便达七百多万吨、生活污水达一千五百多万吨、含油废水一百多万吨。
这些污水，只有百分之一经过处理，高达百分之九十九的废水则是未经任何处理，就直接排放到长江。
对于污水导致三峡库区成为长江污染的重灾区，重庆工学院教授韦云隆表示，三峡库区船舶污染防治工作越早动手实施，解决问题的成本就越低。如果迟到二零零九年三峡工程蓄水一百七十五公尺水位时再实施防治，届时治理难度加大，带来的生态环境损失无法估计。报导引述环保部门的调查指出，目前船舶对三峡库区水域造成的污染主要包括：油污染、生活垃圾、生活污水和船舶事故污染。其中生活垃圾控制较好，治理生活污水方面相对滞后，而船舶事故污染也是危及库区水质的重要源头。百万吨船舶行经葛洲坝，提高大规模水上溢油事故的风险，船舶应急反应的能力却还是空白。
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