清季革命党所用国旗之方式有数种：最初为兴中会所用之青天白日旗，次为中国同盟会所修订之青天白日满地红旗；迄辛亥武昌举义，更有共进会所用之十八星旗、上海光复所用之五色旗、惠州陈炯明所用之井字旗。兹分别叙述其源流及沿革如次：
兴中会之青天白日旗
乙未(一八九五年)春，孙总理杨衢云等日在兴中会香港本部乾亨行商议攻取广州策略，据兴中会员谢缵泰英文笔记所载，是年阴历三月十六日(旧历二月二十日)兴中会干部开会，议决挑选健儿三千人由香港袭取广州之方法，及采用青天白日为国旗之方式，以代满清之黄龙旗云云。缵泰为衢云密友，每次会议恒参与机要，其言至有根据。此旗之方式系陆皓东所设计，皓东即殉于是役，为民族革命流血之第一人。自乙未重阳日广州失败后，青天白日旗初用诸军事者，为庚子(一九○○年)闰八月惠州三洲田之革命军，其后尤列至南洋各埠创立中和堂，令各会所均悬挂青天白日旗，海外华侨团体以革命党徽号为标帜者自此始。当时旗上所排列叉光，多寡不一，缝制者多莫名其妙，后经总理解释，谓叉光即代表干支之数，故叉光应排作十二，以代十二时辰，自是旗上叉光之数始确定不易。
同盟会之红蓝白三色旗
乙巳(一九○五年)七月，中国同盟会成立于日本东京，翌年冬，同盟会召集干事会编纂革命方略，并讨论中华民国国旗方式问题，总理主张沿用兴中会之青天白日旗，谓乃陆皓东所发明，兴中会诸先烈及惠州革命军将士先后为此旗留血，不可不留作纪念。各党员亦提出他种方式，有提议用五色，以顺中国历史上之习惯者；有提议用十八星，以代表十八行省者；有提议用金瓜钺斧，以发扬汉族之精神者；有提议用井字，以表示井田之义者；黄克强对于青天白日，颇持异议，谓形式不美，且与日本旭旗相近。总理争之甚力，且增加红色于上，改作红蓝白三色以符世界上自由平等博爱之真义。仍因意见分歧，迄未解决，后经章太炎、刘揆一设法调解，暂搁其议。于是各种方式均由庶务干事刘揆一保存，作为悬案。然自后丁未(一九○七年)潮州黄冈、惠州七女湖、钦州防城、广西镇南关，戊申(一九○八年)钦州马笃山、云南河口，庚戌(一九一○年)正月广州，辛亥(一九一一年)三月广州诸役，党军咸用青天白日满地红之三色旗为革命标帜。克强迭任主帅，从无反对之表示，故在革命历史上，青天白日旗之为中华民国国旗，实无疑义。
潮惠革命军之国旗
同盟会干部制定革命方略之后，依革命方略第九章因粮规则第二节丁项军事用票第一条之规定，革命军所发行军事用票，一律冠以国旗，并绘成国旗方式，颁发革命军各都督及同盟会各埠分会长使用。丁未春，总理以总理名义任许雪秋为中华国民军东军都督，又任邓子瑜为东军惠州区司令，以余时任同盟会香港分会长，特令赞襄潮惠军务。余接受本部颁到新定国旗方式后，乃使余妇李自平在《中国日报》四楼依样密缝制青天白日满地红旗四梃，分给许雪秋、邓子瑜各二梃，备举义时应用。是年四月十一日，余丑、陈涌波等仓卒举义于潮州饶平县黄冈城，许雪秋时在香港，不及往。革命军既克黄冈，余丑等率众誓师并拍照纪念，照中右侧有人手持青天白日满地红旗，立于其旁者陈涌波也。考清季革命军起事者二十余次，其能从容拍照纪念者，只有潮州黄冈一役，是役所用国旗即余所颁发。
镇南关炮台上之革命旗
丁未十月二十七日，黄明堂、关仁甫、李祐卿率革命军占据广西镇南关炮台，镇南镇中镇北三台均高悬青天白日旗，十一月初四日以弹药告罄，粮食不继，不得已下令退却。时清军取包围式，向山上环攻，明堂等率众冲围而出，及至半山，军中有一小童回顾台上青天白日旗未撤，虑为敌军所得，竟以一人冒险，重登山巅，取回此旗，全军将士咸为称赏不置，诚国旗史上之一佳话也。
