财政部官员则大喊冤枉，认为把大学债务黑洞完全推给政府，不负责任，大学债务危机是多种原因造成，除了扩招，经费不足、大学盲目扩建和投资都有关系。
北京大学"大学负债问题研究"指出，大学负债问题，应是扩招推出后，政府财政支持不足、学生数量急增的双重压力下，地方政府、金融机构和大学三方各打如意算盘，促成大学办学"大跃进"造成的后遗症。
大陆大学贷款始于一九九九年，即大学开始大规模扩大招生的第一年。一九九八年，大学招生一百零八万人，到了二○○二年，招生人数扩大到二百七十五万人，数目成倍增长。
自二○○○年起，大学出现学校合并的风潮，讲究的是学校规模愈大愈好，于是，各地争相开发"亚洲第一大"、"中国第一大"的大学城。加上教育部门规定，每名学生要占多少校园面积，每个专业要达到一定招生量，达不到这些指标，一些专业就被停招，所以，各大学不断圈地，扩大学校规模。
当时，地方政府想借由大学城建设，带动当地经济发展；一些地方政府向大学承诺，未来 可协助学校偿还银行贷款，具体的补助方式有政府全额还本付息，大学还本、政府还息以及大学还本、政府部分贴息几种。
地方政府的盘算是，大学向银行贷款建设，替当地政府解决教育经费投入不足，也带来经济增长效益和促成当地房地产市场荣景。于是，在地方政府鼓励和引导下，许多大学直接向银行大量贷款，扩张操场、教学楼、办公楼乃至圈地。
长期以来，身负重债的各大学，并没有放慢贷款的步伐，银行也没有拒绝贷款。原因在于，大学不像企业，没有财务报表，无法作信贷风险评估。
银行认为，大学有政府部门当靠山，没有太大风险，因此，竞相与大学签订"合作协议"，把钱借给已是债务累累的学校。
原本估算应是地方政府、大学和银行"三赢"局面，却因各大学高估自身能力，举债过多，庞大的债务和可能引爆的大学破产潮，成为三方难以解决的烫手山芋。
