他说，中共一九九九年藉口法轮功为“邪教”组织，展开镇压行动，导致成千上万法轮功学员遭受逮捕拘禁。在“宗教信仰自由”普世价值下，中共对法轮功的打压，只会让人对共产政权专制暴政，更加深恶痛绝。
陈水扁表示，相较于台湾，在宪法保障宗教信仰自由条文下，法轮功在台湾相当活跃，随处可见法轮大法的教学，政府也从未干预过。这就是民主自由、专制极权最大不同处。
近来媒体披露中共对拘禁中的法轮功学员，以活体摘除器官方式，作人体器官移植手术，赚取黑心暴利，再火化毁尸灭迹，行径令人发指，引起国际社会关切。中共更在此事件遭披露后，沉默了三个星期，才由外交部出面否认，并表示欢迎国际社会组团前往调查。
陈水扁表示，虽然目前尚未有直接证据得以证明，但相关人士指证历历、中共境内器官移植手术案例明显较他国偏高、强制对狱中的法轮功学员抽血检验行为、早些年曾引起世界轩然大波的中共监狱出售死刑、重刑犯的器官事件，都赋予事件真实存在的可能性。
沈阳老军医最近再次向海外媒体提供的内部资料正好和陈水扁总统的呼吁遥相呼应。据大纪元新闻网首发报道，老军医揭露了取证困难的原因。他表示，所有被进行器官移植的人员可以分为两类，一类是自愿，一类是非自愿，但是在官方的口径上都是自愿的。法轮功及其他关押人员在关押期间使用的是真实名字，但是在进行器官移植时使用的是伪造的假名字，但是这个人的资料是完整的，而且是在器官移植的自愿书上签字的 (当然是代签的)。因为器官移植的管理是军事系统，一旦成为军事机密是无法获得资料的，也因此造成了取证的困难。
老军医个人接触的伪造代签资料就有6万多份，许多的签字都是一个人的笔迹。这类资料的保存期限是18个月，然后必须销毁。该资料的保存机关为省级军区，查阅资料须经中央驻地方专员批准。如果器官移植失败，被移植器官人员的资料和尸体必须在72小时内全部销毁。整体的资料和尸体，甚至是活人焚毁必须经军事监管人员认可。军事监管人员有权逮捕，关押，强制处决任何泄露消息的医生、警察、武警、科研人员等。军事监管人员由中央军委授权相关军事人员或军事机构执行。
任何被确定将进行器官移植人员，将从监狱、劳教所、看守所、集中营等被带离，此时他们将失去名字，只有一个代号，而与此代号相对应的是一个伪造的自愿进行器官移植的自愿者。而该人员将会被告之将进行身体检查，然后是局部麻醉，接下来就是活体移植。
取证困难并不能成为杀人的藉口。台湾元首的呼吁与老军医的证词能否唤醒中国人也包括中国政府的良心，为此展开深入的调查？值得全世界拭目以待。
