另鉴于国民党已面临政党命脉存续的关键时刻，国民党本土派次团、ｅ盟会长徐中雄主张十六全提前改组，他指出，这是“大破大立”的作为，因为从这次总统选举结果可以发现，连宋合的选票并不是一加一等于二，选票之所以流失，表示党的认同方向、路线出了问题，如果可以让代表国民党权力基础的十六全提前改组，可能营造出新的改革契机，反而有利于年底立委选情。
至于国民党领导人是否要世代交替，立委陈学圣指出，现阶段国亲仍要维持合作平台，避免造成蓝军分裂的危机，但连战的角色可以“微调”，并站在制高点来领导国亲联盟。首先，连战仍兼任党主席，与宋楚瑜共同扮演国亲盟主的角色，因为连战深获亲民党的信任，可以发挥总协调的功能。
陈学圣强调，在确立连战仍为党主席的情况下，党副主席的角色可以重新调整，其中，“王马共治”是相当可行的方案，因为王马分别是南部与北部的代表性政治人物，王马共治下的国民党，相信能展现一番新气象。
提出十六全提前改组主张的徐中雄也认为，连战是相当有政治智慧的领导人，此时党内不宜再提巩固领导中心，否则只会令连更难堪，因为连战不是非做总统或党主席的人，因此，该如何领导国民党，大家应给连战更多空间去思考，同时党内也要有“置之死地而后生”的决心，大选后的内部检讨工作，应与追查总统选举疑云真相案同步进行，不能老是原地踏步。
此外，对于有亲民党立委主张连宋进军立法院一事，王金平昨天表示，他不够高层，所以不知道这件事；国民党政策会执行长曾永权、党团书记长廖风德均说“党内从来没听过”，可能性也不高；立委卓伯源则反问，当过县长的人有可能回头选县议员吗？
王金平则重申力挺连战领导国民党的立场，他并对年底立委国亲提名作业定出新基调，认为国亲应采取策略合作联盟，不是联合提名而已，尤其连宋应一起担任辅选工作，打好立委选举，国亲才能维持立院优势，现在要谁辞职是最不妥适的，他个人也不谈有关接任党主席的事。
