在台湾，卫生署疾病管制局局长苏义仁在参与泰国防制禽流感会议之后，跟农委会主委、卫生署副署长一同前往立法院报告防疫近况。苏义仁说人类对于禽流感病毒并没有免疫力，他忧虑一旦禽流感病毒出现变异传染给人类之后，将会导致短时间内全球数百万人染病死亡。
苏义仁：“如果H５N１来的时候，我们会同样面临着前期Ｈ１Ｈ２Ｈ３的全球大流行，将有全球几百万病人死亡的危险。”
苏义仁进一步解释，禽流感病毒从禽鸟之间交互传染，转变成禽鸟传染给人类的三种情况，包括禽鸟传给猪，又传给人类；第二种，人类流感传染给猪，又传染给家禽；第三种，家禽与人类两种流感同时爆发，导致流感病毒自身的变异。苏义仁并且指出广东省的禽流感疫情变化，正处于高风险期。
苏义仁：“台湾禽流感今年流行Ｈ５Ｎ２，属于闭病源性，这是比较幸运的地方，但是比较忧虑的是我们人类流行性感冒的季节跟禽流感的季节已合在一起。我比较关切的是在广东、华南地区流行Ｈ５Ｎ１，属于高病毒性，而且又有人的流感病毒在流行。”
卫生署疾病管制局预测在今年（2004年）的三月到五月间将会有小波的流行。
立法院邀请防疫部门一级主管发表禽流感专题报告，显见岛内正积极准备总统大选的同时，更感受到防疫的压力。农委会主委李金龙在报告中指出，台湾由于受到地理位置的影响，未来不排除可能会成为禽流感发生的地区。但强调，台湾目前并不是高病源性禽流感的疫区。
李金龙：“在我们的西边有大陆和香港，南边有越南、泰国、柬埔寨、寮国等等，所以我们是采取高度的警戒。当然我们也不排除高病源性家禽流行性感冒入侵的可能性，我们以最近一年的监测，监测的结果证明，我国目前仍然是高病源性家禽流行性感冒的非疫区。”
而台湾的行政院则宣布了一系列的防疫因应措施，包括：必要时机，全鸟停止上班上课，准备足够的棺材等殡葬物料，以及加强查缉走私农产品等等，并且强调禽流感比ＳＡＲＳ更严重。
而台湾政府更质疑大陆方面涉嫌隐匿禽流感的疫情。
行政院发言人林佳龙说：“从ＳＡＲＳ的经验与教训，我们知道各国疫情资讯的透明与分享，是疫情能否有效防治的关键。而根据了解，世界卫生组织也强烈地希望中国大陆政府不要隐瞒疫情而重蹈覆辙，应当要开诚布公，与世界卫生组织和各国共同来防治疫情的扩大。”
另外，台湾的家畜试验所从先前所查获的大陆走私红面番鸭的身上，检测出越南型Ｈ５Ｎ１禽流感病毒，有９７％的ＤＮＡ序列相似。试验所认为，这一项检验报告结果显示，大陆家禽可能也感染到跟越南病毒极相似的高病源性禽流感病毒。
自由亚洲电台
