“几乎所有的空间项目都困难重重，而且都超过预算多达几十亿美元，”空军司令詹姆斯.罗切说。“这些系统都如此复杂，如果你犯一个错误，那么就会有永久的影响。”
在空间项目所遇到的困难之中最棘手的问题包括两个用于建立以地面为基础的导弹防御系统所必需的两个卫星系统装置。这两个卫星装置出现和设计及相融性有关的问题，今年不得不进行改造思想，使得项目进度慢于原定计划。另外，国家侦察办公室（英文名：National Reconnaissance Office）的新一代取名为“未来图象建筑”的间谍卫星的研制和建造工作已经比原定的计划晚了一年，而且比原定的费用超出了三十亿美元。这引发了五角大楼的一场是否继续该项目的内部争论。
一些政府官员和军工界将美国导弹防御系统项目所遇到的困难归结为九十年代对该项目的财政支持不够稳定，时断时续，军工界的人才匮乏，以及在建立导弹防御系统时所遇到的技术难题。
很多正在“亮红灯”的项目都是在冷战结束之后惨遭预算缩水，当时对武器的费用的关注大于对武器性能的重视。那时所做的决定大都对真正需要的费用开支估计不够现实。
另外，随着冷战的结束，九十年代的军工大项目大幅度减少，几千名军工企业的雇员在这一段时间丢掉工作。这一部分人才流失对美国后来的空间项目的发展造成大的打击。五角大楼预计阿波罗和其他太空项目中的顶尖技术人员会在未来五年内逐渐退休，美国空间项目的“人才危机”会进一步恶化。
陷入困境的多个军事空间项目分别由洛克希德-马丁公司，波音公司，TRW公司和雷神公司承包。
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