鑒湖女俠秋瑾。（圖片來源：公有領域）
臨刑之際，年僅32歲的秋瑾心中，仍然掛念著貧苦百姓。她說「余被拘後，余室內有洋三百元，角子一千元，均被兵差搜去，請務必追出，代余助入平糶局，以惠平黎。」白話大意：「我被捕時，室內還有三百多銀元，小銀幣一千元，都被兵差搜去，請務必追出，代我捐給慈善機構平糶局，用來救濟貧困民眾。」
1907年7月6日，徐錫麟安慶起義失敗後，上海女子師範學堂教師王璧華怕連累秋瑾，已託人與上海法國巡捕房聯繫好，讓秋瑾暫到法租界避避，並且派學生胡踵秋去紹興，護送秋瑾赴滬法租界避難。還千叮嚀萬囑咐，要胡踵秋拉著秋瑾去。但是，7月10日，胡踵秋見到秋瑾時，秋瑾已從報紙上瞭解了安慶起義的全部過程。此時秋瑾也陸續收到浙江多地會黨首領，因準備起義走露風聲，被抓捕甚至遇害的消息。秋瑾悲痛萬分，但仍鎮靜自若，沒有絲毫慌亂，胡踵秋力勸秋瑾到上海暫避一時，而秋瑾則毅然拒絕了，說：
「我怕死就不會出來革命，……如滿奴（指清政府，當時很多革命黨人，都如此稱呼腐敗的清政府）能將我綁赴斷頭臺，革命成功至少可以提早五年，犧牲我一人，可以減少後來千百人的犧牲，不是我革命失敗，而是我革命成功。我決不離開紹興，願與男女兩校共存亡。你回去同我們婦女同志說，要求男女平權，首先要做到男女平等的義務。我不入地獄，誰入地獄。」
不斷有人勸秋瑾撤離，被秋瑾用各種不同的理由和藉口拒絕（這也是後世一些研究者搞不清楚，秋瑾到底是甚麼想法的緣故。其實秋瑾是用她認為能說動此人的理由，來回覆此人，對不同類型的人，是用不同的說法）。
秋瑾11日給上海的徐小淑（徐自華妹，秋瑾學生）寫下遺書。這就是《致徐小淑絕命詞》：
「痛同胞之醉夢猶昏，悲祖國之陸沉誰挽？
日暮窮途，徒下新亭之淚；
殘山剩水，誰招志士之魂？
不須三尺孤墳，中國已無乾淨土；
好持一杯魯酒，他年共唱擺侖歌。
雖死猶生，犧牲盡我責任。
即此永別，風潮取彼頭顱。
壯志猶虛，雄心未渝，中原回首腸堪斷！」
……
7月12日，秋瑾早已經從多方渠道得到密報，知道清政府已派軍來追捕她。
命懸一線之際，秋瑾卻拒絕撤離，她說「危局如斯敢惜身？願將生命作犧牲」。
她已決心堅守大通學堂，用自己的死來保全部下，用自己的死來激勵後人，喚醒國人。
秋瑾從容的銷毀文件名冊、指揮學生埋藏槍枝、遣散部下……囑咐家人避藏……將嫂子張淳芝傾囊幾次送來，催她撤離，供她路上用的幾百銀元，分發給撤離的部下……安全撤離疏散的起義人員，很多成為四年後，辛亥革命期間，浙江和上海等地起義軍的中堅力量。
7月12日，光復軍副統領王金發，冒險喬裝來到大通學堂，勸秋瑾撤離；秋瑾找藉口拒絕，王金發不忍獨自離去，秋瑾聲色俱厲的催促，才將王金發逼走。
7月13日下午，紹興知府貴福、山陰知縣李鐘岳、會稽知縣李端年等，會同浙江新軍第一連隊所屬第一大隊的300名清兵，在隊長徐方昭的帶領下包圍了大通師範學堂。
秋瑾抱定以死來喚醒國人的決心。（圖片來源：公有領域）
現在的很多文學、影視作品中：武藝高強，槍法精準的鑒湖女俠秋瑾，率部與清軍激戰後，力盡不屈被俘。實際上，秋瑾雖已抱定以死來激勵後人、喚醒國人的決心，但她並不願意師生和部下，作無謂的犧牲，而是命令他們轉移疏散，以圖將來。秋瑾當時的表現：就像甚麼都沒有發生一樣，坐等清軍來抓她，武藝高強，身邊有手槍，沒有做任何抵抗，束手就擒。
7月14日，貴福將審訊交山陰知縣李鐘岳。李鐘岳早就仰慕敬佩秋瑾，常以鑒湖女俠「馳驅戎馬中原夢，破碎山河故國羞」的詩句，教育自己的兒子：「以一女子而能詩，勝汝輩多矣！」此時，對秋瑾以禮相待，如同招待客人一般，秋瑾揮毫寫下了「秋雨秋風愁煞人」（後常被錯傳為「秋風秋雨愁煞人」）。
7月14日，貴福收到浙江巡撫張曾敭回電，指示「……秋瑾即行正法……」。
貴福見審訊毫無所獲，斥責李鐘岳後，轉交幕僚余某，連夜用酷刑逼供。余某對秋瑾使用最殘忍恐怖的酷刑：「十字架」和「跪火磚」「跪火鏈」。「跪火磚」「跪火鏈」是獄中逼供的最後手段：在熾熱的火焰中燒烤磚瓦和鐵鎖鏈，施刑時，將人強按著跪在燒紅的磚或鐵鏈上。秋瑾身受火鐵鏈烙燒身體的酷刑，「咬牙閉目，忍受酷刑」，硬忍著巨痛，一聲不吭……酷刑致使秋瑾雙目凸出約二寸，紅絲亂轉，慘不忍睹。最終，貴福幕僚余某等只得偽造供詞，慌亂中年齡都寫錯了。
7月14日當晚，貴福命令李鐘岳監斬，處決秋瑾。李鐘岳仍想保全秋瑾，爭辯說：「供證兩無，安能殺人？」（供詞和證據都沒有，怎麼能殺人）。在貴福的威脅和恐嚇下，李鐘岳無奈，只得帶兵前往獄中。李鐘岳「淚隨聲墮」的向秋瑾宣布這一結果，身邊的衙役們看到這個情景也都「相顧惻然」。
秋瑾聽完，平靜的提出4個請求：「1、准寫家書訣別；2、勿袒衣；3、勿梟首示眾」。李鐘岳答應了後2個請求。秋瑾表示感謝後，最後一個請求是：
「余被拘後，余室內有洋三百元，角子一千元，均被兵差搜去，請務必追出，代余助入平糶局，以惠平黎。」（我被抓時，室內還有三百多銀元，小銀幣一千元，都被兵差搜去，請務必追出，代我捐給慈善機構平糶局，用來救濟貧民百姓）。臨刑之際，秋瑾心中，仍然掛念著貧苦百姓……
7月15日凌晨三點，刑架兵給秋瑾帶上粗重的鐵鐐，把她的雙手反綁在背後。大批舉著火把全副武裝的士兵簇擁著秋瑾，秋瑾帶傷的腳髁拖拽著沈重的鐵鐐，每走一步，都疼痛萬分……周圍的士兵試圖架扶起秋瑾，秋瑾向成群的士兵厲聲喝道：「吾固能行，何掖為！」（我還能走，不用來扶！）……從監獄到行刑的軒亭口，大約至少有六、七百米的路程……
刑場周圍早已聚集了大批群眾，他們吵嚷一片，嘈雜地要看「革命黨女首領被殺頭」，現場人聲鼎沸。
秋瑾被按在刑具旁，劊子手抓住秋瑾的肩膀讓她跪在指定的地方。秋瑾忍受著最後痛徹全身的痛苦，平靜從容的向舉起屠刀的劊子手說：「且住！容我一望，有無親友來別我？」秋瑾張目四望，從容平靜，閉目吩咐：「可矣！」
「上世紀六、七十年代，浙江省博物館裡有個姓裘的老木匠，他曾於1907年7月15日凌晨，親眼看到了秋瑾被殺的全過程。那年，裘木匠才十二歲。後來，他把自己當年的親眼所見講給年輕的同事聽。他說秋瑾被砍腦袋的時候，一刀下去，頭沒有砍下來，砍了好幾刀，才砍下來的。太慘了。很慘的，很淒慘的，一刀下去沒有死，再第二刀，第二刀還沒斷，再第三刀。……」
……
「祖國陸沉人有責」
「芸芸眾生，孰不愛生？」……
「余被拘後，余室內有洋三百元，角子一千元，均被兵差搜去，請務必追出，代余助入平糶局，以惠平黎。」
秋瑾死後，紹興的居民，紛紛傳誦著秋瑾臨刑前作的這個交代，很多人流下了眼淚……
「誰為濟時彥？相與挽頹波」
「一腔熱血勤珍重，灑去猶能化碧濤」
「天生才氣非無意，震盪乾坤待轉旋」……
在秋瑾被害後的一百多天內，主持對秋瑾行刑的山陰縣縣令李忠岳備受煎熬，連續自殺三次，最終自縊而亡。
「悲哉秋之為氣；慘矣瑾其所懷」……
有人說：「慈禧，以一國換一己之福。但又有誰，拿一己，換一國之福。」
有人說：「秋瑾選擇以死殉國，實則是以死喚醒億萬民眾，激勵後來者。她的死，推動了辛亥革命。」
有人說：「秋瑾非為個人而死，非為女界而死，實為我男女四萬萬人共有之國家而死……」
有人說：「古往今來，秋瑾這樣的能有幾人？端莊秀麗，劍氣俠風，文采蓋世，毀家紓難，仗義疏財，如此大氣磅礡，有過如此瑰奇的經歷，具備這樣強烈的個性色彩，敢於以自己的頭顱來喚醒民眾，慷慨赴死，其壯舉讓中外為之震撼，讓清王朝在世人面前，徹底喪失了道德存在感，以一己之力，拯斯民於衽席，奠國運如磐石。一個具大才、立大業的弱女子能夠力挽狂瀾，成為辛亥革命的中流砥柱，百年之後，依然受到後人永遠敬仰崇拜的，只有秋瑾。」
註：
1.「祖國陸沉人有責」—秋瑾《感時》；
「芸芸眾生，孰不愛生？」—秋瑾《光復軍起義檄稿》。
2.「上世紀六、七十年代，浙江省博物館裡有個姓裘的老木匠，……」—原浙江省博物館館長毛昭晰老先生回憶。
3.「危局如斯敢惜身？願將生命作犧牲」—秋瑾《贈蔣鹿珊先生言志且為他日成功之鴻爪也》；
「誰為濟時彥？相與挽頹波」—秋瑾《感事》；
「天生才氣非無意，震盪乾坤待轉旋」—秋瑾詩詞集《秋雨秋風集》；
「一腔熱血勤珍重，灑去猶能化碧濤」—秋瑾作於1904～05年留學日本期間。
4.「悲哉秋之為氣；慘矣瑾其所懷」，秋瑾就義當天，刑場軒亭口出現的對聯。
