六四反對流血的四名中顧委委員之一，96歲的李昌9月3日在北京醫院去世，10日遺體告別式在八寶山革命公墓最大的遺體告別廳一號廳舉行。妻子馮蘭瑞泣挽的潔白色的鮮花圈，放在最前端。李昌身後彩色照片下是五個子女比肩的五個鮮花圈。
告別廳的右手是胡錦濤、江澤民和其餘八個常委依次獻的十個大花圈。再依次是政治局委員和前國家領導人還有他們的親屬組合獻的花圈，一直排到告別廳門口。左手是親屬和友好的花圈，也一直排到大門口。
八點半鐘，八寶山實行交通戒嚴，已經來到的弔唁人群被警察和便衣統統封鎖到東邊長廊，讓去排隊等候。常委、副總理李克強，常委、中紀委書記賀國強前來送別。3日李昌臨終之前，賀國強曾到北京醫院探望。等李克強、賀國強還有李繼耐、喬石夫人的專車相繼駛離，戒嚴解除，對公眾和生前友好的遺體告別式才開始。之前被猜測會來的常委李長春沒有來，李長春是李昌任過校長的哈工大的畢業生。
李昌遺體告別式規格介於部長和國家領導人之間，不能算不隆重。現國家領導人悉數敬獻了花圈，有兩個原因：一，是因為李昌的資歷比較現在所有的領導人都老；二，李昌工作過的部門也令今天的領導人忽視不得，還要格外器重。
1931年「九一八」事變，李昌十七歲就在在上海參加了抗日救亡運動；1935年考入清華大學，作為學生骨幹在北京參加「一二九」運動，1936年被選為中華民族先鋒隊全國總隊長；1939年在延安，他倡言發揚民主精神，尊重青年組織的獨立性；1949年2月被任命為中共北平市青委書記、共青團北平市工委書記。1951年任團中央書記處書記。1953年出任哈爾濱工業大學校長，主張教育與科研、生產、國防任務相結合；文革期間，李昌受到過殘酷迫害，1975年在中科院任內和胡耀邦一起，堅決抵制文革路線，參加草擬聞名於世的《關於科技工作幾個問題的匯報提綱》；改革開放以後，始終堅持胡耀邦全面改革的方針。1982年李昌當選為中央紀律檢查委員會委員，擔任中紀委書記。他是中共第八屆候補中央委員、第十一屆、第十二屆中央委員，第四屆全國政協常委，第五屆全國人大常委。1985年當選為中共中央顧問委員會委員。
今天李昌工作過的團中央、中國科學院、中紀委也組團來向他送別。一批哈工大的老學生，都是近八十的老人，告別式結束後還提出和馮蘭瑞一起合影。馮蘭瑞和子女們為了尊重官方的安排，除了花圈，沒有散發家庭的紀念品。一份官方氣味十足的《李昌同志生平》是簽到處唯一發放的紀念物。這份生平第一段，第四行，在介紹李昌身份「中紀委原書記李昌同志」後邊加了一個括弧，裡邊註明（當時設有第一書記）。
