加拿大情報部門指孔子學院配合了中共對西方國家的滲透，主持孔子學院的人士否認這種說法。中國問題專家認為，孔子學院確實是中共對外擴張軟實力的工具。自由亞洲電臺特約記者錫紅從加拿大發來的報導。
加拿大情報局局長法登日前指，孔子學院受制於中國政府。加拿大滑鐵盧大學孔子學院院長李彥立即反駁說，法登言論的背後是中國威脅論的陰影，這是因為一些害怕中國崛起的人，在別有用心地造謠。李彥認為，法登對孔子學院顯然一無所知，其言論是道聽途說的結果。她介紹說，滑鐵盧的孔子學院是經滑鐵盧大學校長與南京大學校長雙方協定之後成立的，並沒有任何第三方的參與。但是李彥也承認，在孔子學院的運作上，中國政府會給一定的啟動資金；同時，還派來一位中方的代表，負責部分日常管理和教學工作。
居住在加拿大維多利亞島的中國問題專家、原中國人權律師郭國汀認為，中國政府在海外大規模設立孔子學院，是中共開展其對外戰略的一部分。郭國汀說，中共是在利用孔子，是在盜用孔子的歷史文化及道德信用等資源。郭國汀認為，孔子學院的架構和性質有利於中共向海外進行滲透。郭國汀表示，加拿大情報局局長法登對加拿大社會的警告是必要的。郭國汀最後分析認為，中共的意識形態事實上與孔子思想及道德倫理完全背道而馳。
據加拿大《環球郵報》的報導， 加拿大安省的布魯克大學（Brock University）剛剛宣布，秋季開辦安省第三所孔子學院。布魯克大學透露，中國國家漢語國際推廣領導小組辦公室，簡稱「漢辦」提供15萬美金作為啟動資金，每年再投入10萬美元項目基金。在過去五年內，加拿大成立了七所孔子學院。加拿大情報局前任官員朱諾‧凱蘇雅對外指出：「籌辦孔子學院並不是出於慈善理念，而是中共戰略的一部分，與中共間諜部門有關聯的機構為其提供資金。」
中國官方也有大量報導指，孔子學院發展奇速，從2004 年出現第一所孔子學院，到2010年的短短六年間，中國政府將在海外開辦第500所孔子學院。
