據21世紀人才報．大學週刊報導:2005年中國大學排行榜在指標設計方面根據評委會的意見，在以前年度的基礎上進行了適當的調整，重新劃分了類別，採用三級評價指標體系，共有科學研究、人才培養和綜合聲譽3個一級指標， 9個二級指標，34個三級指標。評價指標概括起來有三大特點，一是全部選取反映高校質量的指標，文理兼顧。如2004年國家級科技獎勵、國家重點實驗室、工程研究中心、國家重點學科和教育部人文社科重點研究基地等指標。二是注重指標數據的時效性，注重積累性指標與年度指標的結合，以積累性指標為主，排行榜中50％左右指標數據均反映了高校2004年度的狀況。高校在2004年度所取得的各類成績都及時地體現在排行榜中，如剛剛打破六年空缺獲得2004年國家科學技術發明最高獎項的中南大學和西北工業大學憑藉其在2004年度突出的科研成績排名分別比去年前進3個名次，位居第15位和21位。三是獨立調查保證排名的公正、客觀和權威，此次排行榜高校聲譽指標引用了中國兩家權威網路媒體TOM 教育 2005年中國高校聲譽調查和搜狐2004年中國高校人氣榜的調查數據，據統計約有150萬網友參與調查。另外在人才培養質量方面增加了2004年度畢業生入圍福布斯、胡潤和南方週末中國富豪排行榜人數等反映高校培養創新人才能力狀況的導向性指標。
位居科研研究、人才培養和綜合聲譽前十的高校如下：
「科學研究」最強的十所大學依次是：清華大學、北京大學、浙江大學、武漢大學、華中科技大學、南京大學、復旦大學、上海交通大學、吉林大學、中南大學。
「人才培養」最強的十所大學依次是：北京大學、清華大學、復旦大學、浙江大學、南京大學、武漢大學、上海交通大學、吉林大學、中國人民大學、中山大學。
「綜合聲譽」最強的十所大學依次是：清華大學、北京大學、中國人民大學、華中科技大學、復旦大學、中國科技大學、南京大學、北京理工大學、浙江大學、武漢大學。
