據中國時報3月3日報導，上海南亞醫院是第一家由臺灣人出資的醫院，當初是以大陸人頭申請註冊醫院，但今年過年前卻發生大陸人頭想吃掉這家醫院的事件，如今兩造走上法庭，針對所有權打上官司。
副院長郭青雲表示，醫院成立時雙方說好，國內部由中方人頭管理，外賓部由他管理，後來中方人頭竟違反合同上的協議，開始要求要外賓部的經營權，還要讓大陸醫生看臺灣病人，以謀取更高的利潤，並且有意侵吞醫院的資產。
郭青雲指出，中方的要求當然無法答應，他們根本一毛錢都沒出，竟想要求更多的醫院管理權，併進而侵佔醫院，因此從去年底南亞醫院的臺灣出資者便向法院提出訴訟，開過兩次庭後，長寧區地方中級法院認為無法審理，必須送件到中央處理，於是要求雙方私下合解。
目前對方提出的條件是拿到一百萬人民幣後就走人，但郭青雲要求要分期付款，以免日後還來找麻煩，他無奈的說，「這種事用錢解決最快！」
郭青雲並坦承，這段時間醫院生意受到很大的影響，光是一天的營利就掉為原來的三分之一，而且新的儀器他們也不敢進，怕所有權一旦有爭議，這些資產都進了對方的口袋。另外，醫院的行銷廣告也受到中方的制肘，反正就是想盡辦法找你麻煩。
至於其他到上海醫療市場探路的臺灣醫師個體戶，情況也不是太樂觀，這些醫生大部分是以承包上海當地醫院某個專科的方式，與院方拆帳，但盈虧自負。
例如上海雲山醫院曾與一名臺灣醫生、曾姓檢驗師和臺灣牙科醫生合作，上海瑞金醫院裡的瑞昌醫院，也曾找臺灣醫師合作，藉以招徠臺灣顧客，但由於醫院設備不正規、醫事力量薄弱以及技術不足等問題，合作得不是很愉快，這種中、臺合作關係，大約勉強維持個半年到一年就拆夥。
中山醫院的台海醫療中心，是以這種經營方式存活至今的其中一例，主要原因是中山醫院為國營大型醫院，有中山醫院的資源支持，因此能降低成本，其次，收費低廉，臺灣人的看診收費也比照當地人沒有醫保的價格。不過，來看病的人以當地人居多，一天兩三百個病人中，臺灣人大約有廿幾個。
台海醫療中心醫師葉映輝說，上海醫療市場的確大，但幾乎都把持在國營醫院的手上，主要是這些醫院有醫保，當地民眾可以低價看病。至於台商的市場，上海的臺灣人固然很多，但很分散，不可能叫一個住在浦東的臺灣人，跑到松江去看病，客源其實有限。
陳姓醫師則表示，臺灣人在上海的看病原則是，「小病吃成藥、大病回臺灣」，會跑去看病的人，大多是因為感冒發燒、肚子痛、拉肚子等急症，專醫這種小病小痛，醫院不太可能賺錢。
此外，最常看病的通常是老年人和小孩，但來上海的臺灣人以三十到五十歲居多，就算是要固定長期上醫院的慢性病人，大部分又會在臺灣以健保方式拿三個月的藥，所以生意沒有想像中的好。
