委員會的國際專家將通過實地監測等方式對遺產地保護狀況提出肯定、鼓勵或是提醒、警告等意見，警告後如若不為所動，將被處以"黃牌警告"--列入《瀕危世界遺產目錄》，如果情況繼續惡化，將對遺產地處以"紅牌"--從《世界遺產名目錄》中刪除。
以下，就是除卻黃山之外的，引起媒體廣泛關注和爭議的4件遺產破壞事件。
張家界被自然文化遺產組織警告
武陵源風景區由我國第一個國家森林公園張家界和天子山、索溪峪兩個自然保護區組成。1992年12月，被聯合國教科文組織正式批准列入《世界遺產名錄》。
前些年，景點附近不斷新建飯店和商業網點，致使景區"城市化"、"人工化"、"商業化"現象越來越突出，環境污染日益嚴重。1998年9月，聯合國教科文組織官員在武陵源進行遺產監測時，對這種現象提出了尖銳批評，認為"在峽谷入口區和天子山這樣的山頂上，其城市化對自然界正在產生深度尚不清楚的影響"；"將道路和旅館糟糕地定位於河邊，給河床擠窄的地方造成危險隱患"；"武陵源現在是一個旅遊設施氾濫的世界遺產景區，大部分景區現在像是一個城市郊區的植物園或公園。"
1999年5月，國務院對武陵源保護情況進行調查後指出：武陵源資源非常珍貴，不可再生，要採取比一般景區更為嚴格的保護措施。
2001年4月，朱總理視察張家界時特別就生態環境保護作出重要指示，要求加快武陵源風景區內建築物的拆遷步伐，加大退耕還林和綠化力度。
這一切對張家界市委、市政府不啻於當頭棒喝，他們把拆遷景區內煞風景建築物作為2001年全市15件大事之一，拆除了絕大部分旅遊設施和居民經營用房。拆遷後，每個景區只保留一處管理用房、1－2個快餐廳或茶房。
但近聞，張家界風景區又將斥億元巨資，興建號稱"世界最高的全暴露戶外電梯"，此舉動再度引起廣泛爭議，批評者認為，觀光電梯的建設將使本已惡化的武陵源自然景觀雪上加霜。
曲阜"三孔"文物被水沖
山東曲阜"三孔"(孔府、孔廟、孔林)1994年被列入世界文化遺產。隨著文物管理體制的變動，"三孔"等文物景點劃歸旅遊公司經營管理。
2000年11月22日下午，孔子國際旅遊股份有限公司職員龐某私自駕駛貨車到孔廟拉引火柴時，將一座元代"御賜尚饗奠之記"碑，撞成六大塊和若干粉碎小塊，以至無法復原。該碑是孔廟內重要的元代記事碑，屬國家珍貴文物。
緊接著12月間，該公司在三孔內進行大規模的衛生掃除，在整個文物景區中，古建築均有不同的油漆彩繪脫漆現象。其中孔廟最為嚴重，因為清洗或擦拭，一些古建築大面積彩繪已模糊不清。孔府內重光門"恩賜重光"匾的金箔全部脫落，前後堂樓走廊天花已部分露出原木底。大面積建築木架木質內滲水，造成漆層拱起，將會進一步脫落。而被水沖洗的石碑，一旦碑刻的石隔內滲水，結冰後，石碑將會裂縫斷開。
一位專家憤慨地說："孔子是中國人的精神之源，也是世界人民心目中中國的一個符號。我們這樣不負責任簡直就是自毀文明。"
泰山索道撼不動
泰山擴建索道一事，引起全國喧沸，2000年整個一年，全國人民都在關注。但是撼泰山易，撼泰山索道難！
從當年年初開始，新聞界就呼籲停建泰山索道，闡述了強烈的反對意見，並表示了對地方利益集團獨攬大權的憤慨--"泰山建索道誰說了算?"
2000年8月，北大、清華、建設部、國家文物局等部門的14院士、教授再次呼籲拆除中天門--岱頂索道，全國媒體又給以隆重報導。但是，在全國輿論的密切關注下，在各專家學者的強烈呼籲下，泰山索道擴建工程仍逆流而上，頂住各種壓力，在國慶節前完工。
記者採訪建設部有關部門，但有關領導說不便作出評價，同時希望新聞媒體也能給泰山索道問題以"冷處理"。
事實上，早在1980年建中天門--岱頂索道時，有關單位在先定了方案，並預訂了索道設備之後才象徵性地"徵求"建築學會專家們的意見，結果絕大多數專家憤而退出會場以示抗議。之後泰山因修索道站月觀峰被炸壞，索道沿線砍了很多松樹，對泰山造成了不可估量的損失。
周口店：失落的聖地
世界考古工作者的"朝聖之地"北京周口店，正逐漸失去昔日令人神往的風采--洞穴瀕臨坍塌、大量堆積物常年風吹日晒、雜亂生長的植物拚命破壞岩石的原生態。
建於１９５３年的周口店遺址博物館看起來非常陳舊，無論是這裡的建築還是管理都明顯帶著已經過去的時代氣息。展覽中存在的粗陋和不規範隨處可見。缺乏豐富的講解和說明，令普通觀眾感到乏味。
專家原來設想，周口店應建成大型遺址公園。公園裡草木豐茂，"史前動物"自由奔跑，廣闊的"原始森林"時隱時現，一些模擬的"史前人類"身著獸皮，烘烤著"火焰"取暖。沒有創意和情趣的展覽便無法成為教育人才、傳播知識的基地。這或許是周口店遊人數量逐年下降的一個重要原因吧。
周口店的另一大傷感是，七十年來研究無大進展。因為大量已經出土的標本和化石還沒有被認真研究過。目前應該把挖好的研究透，留下一部分讓後人檢驗。
周口店一些出土的材料被打包後幾乎沒有啟封整理過，有的甚至已經風化。周口店大批的古化石長期存放在地下室，不僅無法進行整理，而且保管狀況不佳，古化石的損壞日趨加重。
