香港星島日報14日報導說，不過，很多專家仍對「意外墜毀」的說法抱持質疑的態度。
美國運輸安全局官員布萊基週二早上接受美國廣播公司訪問時指出︰「駕駛艙的錄音儀是我們現有的最主要資料，而聽過裡面的錄音後，我們發現駕駛艙內並沒有任何不尋常的活動，沒有任何聲音可以讓我們推測出除了飛行意外之外，還有其他的肇事原因。」
但仍有很多專家認為，恐怖襲擊並無完全不可能。曾擔任空軍軍官的英國恐怖專家亞德利指出︰「九一一事件發生後不能排除這是襲擊的可能性，他們很可能因為機場增強保安而改變策略，雖然劫機變得更困難，但並不代表不可能放置炸彈。」
而另一個更可怕推測是，墜毀的雙引擎客機有可能被恐怖份子以火箭炮擊落。事實上，想要在美國取得攜帶輕便的火箭炮並非難事，《珍氏世界陸軍》編輯海曼少校指出︰「火箭炮並不稀有，在某些州你甚至可以在門市店買到，至多隻需要出示駕駛執照，而且這些火箭炮很容易走私進來。」
但海曼表示，由於肩扛式的火箭炮射程一般很短，並不容易由遠距離擊落飛機，除非發動襲擊的人是由跑道盡頭下手。火箭炮甚至可以透過郵購的方式買到，在被雇佣兵團視為聖經的《幸福之兵》的軍事雜誌上，就經常可以看到火箭炮的廣告。去年十二月，英國海關就曾截獲一支空運自美國軍火廠的火箭炮。當時海關人員以 X光探測到該包裹，打開之後發現裡面赫然是一足以在一千尺外擊毀一架坦克的三尺長綠色火箭炮。炮身的發射裝置以鋁質栓卡死，但只要以鉗子拔走鋁質栓，數分鐘內就可以發射出巨大破壞力的炮彈。
報導說，雖然美國當局認為肇事原因極可能出於機件故障，不過，法國的空中巴士製造商卻指A300型號從未有過起飛時墜毀的案例，特別是升空時引擎剝落的情況更是罕見。但A300型號由通用電氣負責生產的引擎，在一年前曾被發現引擎具有導致故障的缺點，導致全球所有A300型號客機必須進行緊急驗查維修，並且在每飛行一萬小時後，就必須進行徹底維修。
美國航空人員表示，客機的引擎維修記錄將會成為調查空難原因的主要□索，該客機左邊的引擎在墜毀時飛行時數隻有六百九十四小時，但右邊則累積至九千七百八十八小時。而包括週一墜毀的美航客機在內， A300型號自一九九四年至今曾發生三次空難，不過，另外兩臺都是比較舊款的A300，而週一墜毀的則是較新型的A300-600型號
